Tretí film Men in Black je pokračovaním slávnej americkej komédie. Obsadenie je rovnaké ako Tommy Lee Jones a Will Smith. Prácu režiséra prevzal opäť Barry Sonnenfeld, výkonný producent Stevena Spielberga. V kinách sa film začal 23. mája 2012.
Tentoraz rolu negatívneho hrdinu prevezme Jamain Clement, hrá Borisa. Toto je zločinec, ktorý utiekol z lunárneho väzenia. Horí s nenávisťou voči agentovi Kayovi, ktorý v júli 1969 chytil zločince a nechal ho bez ruky. Keď Kay náhle zistí, že Boris utekal, vyjadruje veľké poľutovanie nad tým, že ho počas zatknutia nezabil. Potom agent jednoducho zmizne, a to si len Jane pamätá, že existoval. Zvyšok čierneho personálu si myslí, že Kay zomrel v roku 1969 pri stretnutí s niektorými zločincami.
Jediným vysvetlením tohto otrasu reality je zmena v minulosti. Jay a agent O sa rozhodli, že bol zapojený Boris. Potvrdenie tohto je ďalšou udalosťou kozmického rozsahu - inváziou rasy Borisa na Zemi. V predchádzajúcej realite to nebolo možné, pretože Kay nainštaloval na planétu ochranné zariadenie s názvom „ArcNet“. Teraz, v súvislosti so smrťou agenta pred niekoľkými desiatkami rokov, Zem nemala žiadny skríning pred vesmírnymi nepriateľmi.
Jay zistí, že Boris poslal do minulosti Jeffrey Price, obchodník s elektronikou, ktorý mal vo svojom arzenáli nelegálny časový posunovač. Agent nemá na výber, ale musí sa vrátiť včas, aby zachránil svojho partnera. A okamžite ho zatkne mladý Kay. Počas výsluchu mu Jay povie všetko a budúci partner verí. Spoločne nájdu Arcanian Griffin, ktorý má ArkNet. Teraz traja pokračujú vo svojej ceste a vydali sa na ochranu Mesiaca. Ale na rakete sú uväznené plukovníkom. Teraz sa stáva strážcom tajomstva Jay.
Od tejto chvíle prebieha rýchly vývoj udalostí. Hrdinovia sa stretnú s dvoma Borismi a nastane boj. Zločin z budúcnosti je hodený do raketovej bane a mladý Boris za ním tiež ide. Je nainštalovaná ochrana uzemnenia. A teraz sa zdá, že Jayova misia bola dokončená, ale objaví sa zázračný prežívajúci mladý zločinec. Plukovník zomrel, ale Borisovi sa podarilo zničiť. A vo filme sa objaví nová postava. Chlapec vystúpi z plukovníka a začne hľadať svojho otca. Agent sa uznáva. Jay sa vráti v pravý čas a stretne sa s Kay v kaviarni. Všetko sa vrátilo.